Σε συνέντευξή του στην τηλεοπτική εκπομπή «Αντιθέσεις» του σταθμού Κρήτη TV, ο Αρχιεπίσκοπος Κρήτης, Ευγένιος, τοποθετήθηκε επί του θέματος των ομοφυλοφίλων ζευγαριών και του γάμου τους. Εξέφρασε την άποψη ότι όλοι είναι τέκνα του Θεού και δεν πρέπει να γίνεται διάκριση με βάση την σεξουαλική τους ταυτότητα, τονίζοντας την αποδοχή και την αγάπη προς όλους. Αναφέρθηκε επίσης στην ανάγκη για κατανόηση και ευαισθησία απέναντι στις προσωπικές επιλογές και τις εμπειρίες του καθενός.
Μίλησε για την ετερότητα, υπογραμμίζοντας ότι δεν θεωρείται αμαρτία και επισήμανε την αγάπη της Εκκλησίας προς τον αμαρτωλό, αλλά όχι προς την αμαρτία. Επίσης, αναφέρθηκε στην στάση της Εκκλησίας απέναντι στα ομόφυλα ζευγάρια, δηλώνοντας ότι δεν τους καταδικάζει, αλλά προσπαθεί να τους βοηθήσει.
Αναφορικά με το θέμα της τεκνοθεσίας από ομόφυλα ζευγάρια, εξέφρασε τις ανησυχίες του και τόνισε την ανάγκη για επιστημονική προσέγγιση και κατανόηση των ψυχολογικών και πνευματικών συνθηκών των παιδιών. Τέλος, μίλησε για την προσέγγιση της Εκκλησίας σε θέματα όπως ο γάμος και η τεκνοθεσία από ομόφυλα ζευγάρια, υπογραμμίζοντας τη σημασία του δικαιώματος της πολιτείας να νομοθετεί, αλλά και τη δική της θέση στο θέμα.